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Asociación genotipo-fenotipo en grupos de Agave durangensis por medio de marcadores ISTR y validación de los grupos por regiones ITS.

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dc.contributor.advisor Torres Morán Martha Isabel
dc.contributor.author Ríos Villaseñor Luis Guillermo
dc.contributor.editor Centro universitario de Ciencias Biológicas y Agropecuarias
dc.contributor.editor Universidad de Guadalajara
dc.contributor.other Maestría en Ciencias en Biosistemática y Manejo de Recursos de Naturales y Agrícolas
dc.date.accessioned 2020-07-23T06:14:18Z
dc.date.available 2020-07-23T06:14:18Z
dc.date.issued 2017
dc.identifier.uri http://repositorio.cucba.udg.mx:8080/xmlui/handle/123456789/6068
dc.description Tesis (Maestría en Ciencias en Biosistemática y Manejo de Recursos de Naturales y Agrícolas). Universidad de Guadalajara. CUCBA.
dc.description.abstract Agave durangensis se distribuye de manera natural en el Sur de Durango y en el Norte de Zacatecas, es un agave utilizado en la industria de elaboración de mezcal, el cual cuenta con una denominación de origen, misma que le atribuye características especificas que vuelven atractiva a esta bebida para la industria y la captación de divisas. Sin embargo, existe controversia entre los taxónomos acerca de los tipos de agave que son colectados para la elaboración de la bebida que se obtiene a base de este agave, ya que los productores eliminan el escapo floral de las plantas silvestres, en recorridos que realizan para seleccionar las plantas que van a utilizar, impidiendo con esto la floración y con ello la observación de características necesarias para la identificación taxonómica. En el presente estudio se utilizaron los marcadores molecular ISTR e ITS (para la región ITS2) para diferenciar tres grupos fenotípicos dentro de Agave durangensis. Los marcadores ISTR usados en el presente estudio detectaron altos niveles de polimorfismo en las muestras analizadas y permitieron separar las muestras de acuerdo a las características morfológicas especificas de cada uno de los grupos estudiados. Para el caso del marcador ITS, la comparación de las secuencias ITS2 de A. durangensis con las reportadas en GeneBank (AM884828.1; AM884829.1 y AM884836.1) presentaron altos porcentajes de identidad con A. rhodacantha (99%), A. gentry (99%) y A. salmiana (90%). Estos resultados corresponden a la semejanza fenotípica que comparte A. durangensis con estas especies. Debido a que no se observaron diferencias nucleotídicas en la región ITS2 entre las muestras de A. durangensis , se sugiere utilizar la región ITS completa ya que su poder de discriminación entre los fenotipos fue limitado.
dc.description.tableofcontents ÍNDICE........................................................................................................................................................... I ÍNDICE DE CUADROS ................................................................................................................................... III ÍNDICE DE FIGURAS ..................................................................................................................................... IV RESUMEN .................................................................................................................................................... 1 I. INTRODUCCIÓN ........................................................................................................................................ 2 OBJETIVO GENERAL ............................................................................................................................................. 4 Objetivos específicos ................................................................................................................................. 4 HIPÓTESIS ......................................................................................................................................................... 5 II. REVISIÓN DE LITERATURA ........................................................................................................................ 6 2.1 LA FAMILIA DE LOS AGAVES ............................................................................................................................. 6 2.1.2 IMPORTANCIA DEL GÉNERO AGAVE EN MÉXICO ............................................................................................... 7 2.2 ESTUDIO DE LA VARIABILIDAD EN AGAVES ........................................................................................................... 7 2.2.1 ANTECEDENTES DE VARIABILIDAD MORFOLÓGICA Y MOLECULAR EN AGAVE DURANGENSIS ........................................ 8 2.3 AGAVE DURANGENSIS Y SU IMPORTANCIA EN LA INDUSTRIA DEL MEZCAL ................................................................ 10 2.4 MARCADORES ISTR Y VARIABILIDAD GENÉTICA ASOCIADA A RETROTRANSPOSONES .................................................. 11 2.5 RELACIÓN ENTRE MARCADORES MOLECULARES Y TAXONOMÍA .............................................................................. 12 2.5.1 Gen matK ....................................................................................................................................... 14 2.5.2 Gen rbcL ......................................................................................................................................... 14 2.5.3 Espaciador intergénico trnH-psbA ................................................................................................. 14 2.5.4 Espaciador intergénico psbK-psbL .................................................................................................. 15 2.6 LAS REGIONES ITS Y SU IMPLICACIÓN EN LA SISTEMÁTICA MOLECULAR ................................................................... 15 3. MATERIALES Y MÉTODOS ...................................................................................................................... 18 3.1 CARACTERIZACIÓN MORFOLÓGICA .................................................................................................................. 18 3.2 CARACTERIZACIÓN MOLECULAR ..................................................................................................................... 19 3.2.1 ISTR ................................................................................................................................................ 20 3.3 ANÁLISIS DE CORRESPONDENCIA ENTRE DATOS MORFOLÓGICOS Y MOLECULARES ..................................................... 21 3.4 VALIDACIÓN DE LOS GRUPOS FENOTÍPICOS POR ITS2 ......................................................................................... 22 3.4.1 Clonación para secuenciación ........................................................................................................ 23 IV. RESULTADOS Y DISCUSIÓN .................................................................................................................. 24 4.1 CARACTERIZACIÓN MOLECULAR ..................................................................................................................... 24 4.2 CARACTERIZACIÓN MOLECULAR ..................................................................................................................... 26 4.3 ANÁLISIS DE CORRESPONDENCIA ENTRE DATOS MORFOLÓGICOS Y MOLECULARES ..................................................... 29 4.4 VALIDACIÓN DE LOS GRUPOS FENOTÍPICOS POR ITS2 ......................................................................................... 31 4.4.1 Análisis de las secuencias de la región ITS 2 .................................................................................. 32 V CONCLUSIONES ....................................................................................................................................... 35 VI LITERATURA CITADA .............................................................................................................................. 36 VII ANEXOS ................................................................................................................................................ 43
dc.format application/PDF
dc.language.iso es
dc.publisher CUCBA
dc.publisher Universidad de Guadalajara
dc.subject Agave durangensis, plantas silvestres, escapo floral.
dc.title Asociación genotipo-fenotipo en grupos de Agave durangensis por medio de marcadores ISTR y validación de los grupos por regiones ITS.
dc.type Maestría
dc.type Tesis
dc.rights.holder Universidad de Guadalajara
dc.rights.holder Ríos Villaseñor Luis Guillermo


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