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dc.contributor.advisor | López Uriarte Ernesto | |
dc.contributor.advisor | Castro Félix Luz Patricia | |
dc.contributor.author | Arechiga Palomera Martin Alonso | |
dc.contributor.editor | Centro universitario de Ciencias Biológicas y Agropecuarias | |
dc.contributor.editor | Universidad de Guadalajara | |
dc.contributor.other | Maestría en Ciencias en Biosistemática y Manejo de Recursos de Naturales y Agrícolas | |
dc.date.accessioned | 2020-07-23T05:57:53Z | |
dc.date.available | 2020-07-23T05:57:53Z | |
dc.date.issued | 2018 | |
dc.identifier.uri | http://repositorio.cucba.udg.mx:8080/xmlui/handle/123456789/6022 | |
dc.description | Tesis (Maestría en Ciencias en Biosistemática y Manejo de Recursos de Naturales y Agrícolas). Universidad de Guadalajara. CUCBA. | |
dc.description.abstract | Striostrea prismática es un molusco bivalvo de la familia Ostreidae que habita en el sublitoral rocoso desde la costa de Baja California Sur en México, hasta la localidad de Máncora en Perú. Es un recurso tradicional de la pesca artesanal y su cultivo en condiciones de laboratorio se explora recientemente. La sobrepesca, la contaminación y el cambio climático pueden causar cambios en la diversidad genética y en la estructura genética poblacional de los bancos ostrícolas. Por lo anterior, es importante conocer los niveles y la distribución de la variación genética en su rango de distribución geográfica. Con este objetivo, se realizaron pruebas de transferibilidad cruzada en S. prismatica de microsatélites en secuencias no codificantes (SSR) y microsatélites en secuencias que se expresan (SSR-EST) desarrollados en especies de ostiones de la familia Ostreidae. Los resultados de la transferibilidad fueron más bajos de lo esperado debido probablemente a la distancia filogenética de S. prismatica con las especies de ostión utilizadas. La poca eficiencia de las PCRs y la falta de reproducibilidad cuando la amplificación fue positiva, descartaron el uso de los microsatélites para llevar a cabo el análisis genético. Por su parte, los marcadores dominantes ISSR (secuencias repetidas intersimples) fueron lo suficientemente reproducibles y polimórficos para detectar la diversidad y diferenciación en S. primatica. Se evaluaron siete localidades de la costa del Pacífico oriental tropical en tres ecorregiones marinas: i) Golfo de California con Mazatlán (Mz), Tizate (Ti) y Quimixto (Qm); ii) Pacífico transicional mexicano con Punta Peñitas (Pe) y Boca de Iguanas (Ig); y iii) Pacífico centroamericano con Puerto Ángel, Oaxaca (Ox) y El Salvador (ES). Se obtuvieron 103 loci polimórficos ISSR. Los niveles de variación genética en S. prismatica fueron moderados (P= 100%, HT= 0.2354, I= 0.394), Tizate fue la localidad con los índices de variación genética (P= 59.49%, H= 0.153, I= 0.237) significativamente más bajos (P<0.05), mientras que Puerto Ángel presentó los índices de diversidad genética más altos (P=80.58%, H= 0.227, I= 0.354). La diferenciación genética se considera moderada (GST= 0.182 y FST= 0.1381) y Puerto Ángel y El Salvador fueron las localidades más diferenciadas. Los resultados del AMOVA muestran que la mayor parte de la variación molecular existe dentro de las localidades (78%, FPT= 0.215, P= 0.001). El análisis de Mantel (R2= 0.874, P= 0.009) sugiere aislamiento por distancia. El método de agrupamiento Bayesiano indicó que la especie se encuentra estructurada en tres componentes genéticos o poblaciones (K=3), la asignación de estos componentes corresponde a las tres ecorregiones marinas que comprende el estudio; sin embargo, la diferenciación FST entre pares de localidades resultó significativa (P<0.001), lo que sugiere la existencia de subpoblaciones o parches genéticos. En conclusión, S. prismatica presenta niveles adecuados de diversidad genética y se encuentra genéticamente estructurada. Las diferencias en el hábitat se manifiestan en parches genéticos conectados a través de migración de las larvas (Nm= 1.2 a 2.32), la cual se encuentra determinada por la distancia geográfica. Lo anterior, aporta información básica del estado actual que guardan las poblaciones de S. prismatica en el Pacífico oriental tropical a nivel genético, considerando su uso hacia la conservación, manejo y aprovechamiento de dicho recurso pesquero. | |
dc.description.tableofcontents | LISTA DE CUADROS .................................................................................................... i LISTA DE FIGURAS ..................................................................................................... ii RESUMEN ..................................................................................................................... iii ABSTRACT .................................................................................................................... v I. INTRODUCCIÓN GENERAL .................................................................................. 1 II. OBJETIVOS .............................................................................................................. 6 III. ÁREA DE ESTUDIO ............................................................................................... 6 3.1. Golfo de California ................................................................................................ 7 3.2. Pacífico Transicional Mexicano ............................................................................ 7 3.3. Pacífico Centroamericano ...................................................................................... 8 IV. TRABAJO DE CAMPO .......................................................................................... 9 V. Capítulo I. Transferibilidad a Striostrea prismatica de marcadores SSR y EST-SSR desarrollados en especies de la familia Ostreidae. ............................................ 11 1. INTRODUCCIÓN ............................................................................................. 11 2. MATERIALES Y MÉTODOS ......................................................................... 13 2.1. Muestras y extracción de ADN .................................................................... 13 2.2. Selección de marcadores SSR y EST-SSR ...................................................... 13 2.3. Pruebas de amplificación por PCR .................................................................. 13 3. RESULTADOS Y DISCUSIÓN ....................................................................... 15 4. CONCLUSIONES ............................................................................................. 19 VI. Capítulo II. Diversidad y estructura genética del ostión de roca Striostrea prismatica Gray, 1825 (Bivalvia: Ostreidae) en el Pacífico oriental tropical inferidas con ISSR. ....................................................................................................... 20 1. INTRODUCCIÓN ................................................................................................ 20 2. MATERIALES Y MÉTODOS ............................................................................ 23 2.1 Área de estudio y obtención de muestras .......................................................... 23 2.2. Extracción de ADN y amplificación PCR-ISSR .............................................. 23 2.3 Análisis de datos................................................................................................ 24 3. RESULTADOS ..................................................................................................... 27 4. DISCUSIÓN .......................................................................................................... 32 5. CONCLUSIÓN ..................................................................................................... 39 VII. CONCLUSIONES GENERALES ...................................................................... 40 VIII. RECOMENDACIONES ..................................................................................... 41 IX. LITERATURA CITADA ...................................................................................... 42 X. ANEXOS ................................................................................................................... 54 Anexo 1. Extracción de ADN por kit comercial ......................................................... 54 Anexo 2. Protocolo de electroforesis .......................................................................... 55 Anexo 3. Patrones de amplificación para los siete marcadores ISSR empleados en el presente estudio. .......................................................................................................... 56 | |
dc.format | application/PDF | |
dc.language.iso | es | |
dc.publisher | CUCBA | |
dc.publisher | Universidad de Guadalajara | |
dc.subject | Striostrea prismática, cambio climático, diversidad genética. | |
dc.title | Diversidad y estructura genética de Sriostrea prismatica Gray, 1825 (Bivalvia:Ostreidae) en el Pacífico Oriental Tropical. | |
dc.type | Maestría | |
dc.type | Tesis | |
dc.rights.holder | Universidad de Guadalajara | |
dc.rights.holder | Arechiga Palomera Martin Alonso |