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<title>Doctorado en Ciencias en Biosistemática, Ecología y Manejo de Recursos Naturales y Agrícolas</title>
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<title>Estructura y diversidad del ensamblaje de bivalvos en bahía de Mazatlán, México, con énfasis en el estudio del crecimiento y reproducción de Donax punctatostriatus</title>
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<description>Estructura y diversidad del ensamblaje de bivalvos en bahía de Mazatlán, México, con énfasis en el estudio del crecimiento y reproducción de Donax punctatostriatus
Esqueda González María del Carmen
Centro universitario de Ciencias Biológicas y Agropecuarias; Universidad de Guadalajara
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<dc:date>2015-01-01T00:00:00Z</dc:date>
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<title>Filogenia y evolución del género Cosmos (Asteraceae, Coreopsideae)</title>
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<description>Filogenia y evolución del género Cosmos (Asteraceae, Coreopsideae)
Castro Castro Arturo
Centro universitario de Ciencias Biológicas y Agropecuarias; Universidad de Guadalajara
El presente estudio analiza la diversidad, distribución geográfica, filogenia, especiación,
evolución morfológica y sistemática del género Cosmos (Coreopsideae, Asteraceae). Se revisaron
3,650 ejemplares botánicos depositados en 52 herbarios. Todas las especies fueron recolectadas
en campo, incluidas sus localidades tipo. Cosmos incluye a 35 especies, distribuidas de forma
natural en América desde los 38.1° N en EUA, hasta los 36.5° S en Argentina. México es el
centro de diversificación de Cosmos. Treinta y cuatro especies crecen el país y 28 se restringen a
él. El occidente mexicano representa la zona de mayor riqueza y endemismos. La clasificación
infragenérica de Cosmos incluye tres secciones: Cosmos sección Cosmos integra cinco taxa
herbáceas anuales; Cosmos sección Discopoda incluye 24 especies herbáceas perennes; y Cosmos
sección Mesinenia agrupa seis sufrútices. El análisis filogenético de secuencias de ADN de los
ITS y ETS, más atributos morfológicos, soporta la monofilia de Cosmos. El género se reconoce
por la pubescencia de los filamentos del androceo como carácter sinapomórfico. Además,
confirma la relación de grupos hermanos con Coreocarpus congregatus y apoya la transferencia
de especies descritas en Cosmos al género Bidens. Sin embargo, la hipótesis filogenética no
soporta en todos los casos la clasificación infragenérica aceptada basada en hábitos de
crecimiento. En Cosmos sección Cosmos, el hábito anual surgió en dos eventos evolutivos
independientes. Por otro lado, la reconstrucción de áreas ancestrales, sugiere que Cosmos tuvo su
origen hace 3 Ma durante el Plioceno Tardío en la Región Neotropical. La Zona de Transición
Mexicana es el centro de radiación de Cosmos y la amplia distribución del grupo se explica por
24 eventos de dispersión. Los análisis filogenéticos de Cosmos permiten observar que la
poliploidía, la aneuploidía y la diversificación en estrategias reproductivas han sido mecanismos
que permitieron su radiación. Los eventos geológicos recientes en la Zona de Transición
Mexicana, durante la glaciación del Pleistoceno-Holoceno, tuvieron efectos significativos en la
especiación de Cosmos resultando en refugios insulares en distintos pisos de elevación de esta
zona. Por último, es posible que las hipótesis evolutivas generadas en el presente estudio de
Cosmos puedan iluminar procesos similares en otros grupos de Asteraceae.; This work presents an analysis of the diversity, geographical distribution, phylogeny, speciation,
morphological evolution, and systematics of the genus Cosmos (Coreopsideae, Asteraceae). A
total of 3,650 botanical specimens deposited in 52 herbaria were reviewed. All species were
collected in the field, including the type locations. Cosmos includes 35 species which occur
naturally in the Americas, between 38.1° N in the USA, to 36.5° S in Argentina. México is the
center of diversification of Cosmos. Thirty four species are found there and 28 of these are
exclusive to this country. Western Mexico is the center of greatest richness and local endemisms.
The infrageneric sections of Cosmos are: Cosmos section Cosmos with five annual herbs; Cosmos
section Discopoda with 24 perennial herbs; and Cosmos section Mesinenia with six suffrutex
species. The phylogenetic analyses of DNA sequences from ITS and ETS spacers and
morphological characters support the monophyly of Cosmos. The pubescence of the filaments is
the synapomorphy evident in all species of Cosmos. This confirms the sister relationship with
Coreocarpus congregatus, and reinforces the transferral of some species from Cosmos to the
genus Bidens. However, the phylogenetic hypotheses do not support the accepted infrageneric
classification based on growth habit. In Cosmos section Cosmos, the annual habit emerged in two
independent evolutionary events. Ancestral area reconstructions, suggest that Cosmos appeared 3
Mya during the Late Pliocene, in the Neotropical Region. Furthermore, the Mexican Transition
Zone has been the center of radiation of Cosmos while the wide distribution of the group is
explained by 24 dispersal events. The phylogenetic hypotheses support polyploidy, aneuploidy,
and reproductive adaptations as the mechanisms that allowed for its radiation. The recent
geological events in the Mexican Transition Zone and during the Pleistocene-Holocene glaciation
had significant effects on the speciation of Cosmos resulting in its actual distribution in insular
refuges at different elevations there. Finally, perhaps the evolutionary hypotheses in this study of
Cosmos could illustrate similar processes in others groups of Asteraceae.
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<dc:date>2015-01-01T00:00:00Z</dc:date>
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<title>Tolerancia genética de los nopales, Opuntia sps., cultivados en Jalisco, a la enfermedad “mancha negra” producida por Pseudocercospora opuntiae</title>
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<description>Tolerancia genética de los nopales, Opuntia sps., cultivados en Jalisco, a la enfermedad “mancha negra” producida por Pseudocercospora opuntiae
Ochoa María Judith
Centro universitario de Ciencias Biológicas y Agropecuarias; Universidad de Guadalajara
En el presente trabajo de investigación se identificó morfológica y molecularmente el hongo fitopatógeno (Pseudocercospora opuntiae) en sistemas productivos de nopal (Opuntia sps.) para fruta y verdura en México occidental (Ojuelos y Zapopan, Jalisco). La patogenicidad y virulencia del hongo se mostró en cladodios pre-cortados, en plantas completas en condiciones de campo, invernadero, in vitro y en Phaseolus vulgaris como una especie hospedera. Asimismo, se utilizaron distintos procesos de micropropagación y multiplicación de los genotipos seleccionados con aparente sanidad. En la obtención de callos el Picloram mostró un desempeño destacable aunque no se pudo obtener regeneración. No fue posible encontrar genotipos por su capacidad embriogénica. La propagación por trozos de cladodios resultó óptima para incrementar material seleccionado; los genotipos evaluados mostraron una respuesta diferencial en cuanto a número y longitud de brotes bajo las mismas condiciones ambientales y edad del cladodio. Se estableció un protocolo de germinación en semillas de diez cultivares de Opuntia sps. in vitro y ex vitro. La germinación se incrementó en un 40 % por escarificación mecánica. Se demostró que el ácido giberélico juega un papel esencial en la promoción de la germinación (por encima de 90 %), mediante el aumento de la actividad amilolítica en las semillas germinadas. Por otro lado se obtuvo un extracto de Pseudocercospora opuntiae en el que se evaluaron actividades enzimáticas de amilasa, proteasa y celulasa enzimas relacionadas con la patogenicidad y virulencia del hongo. También se observó que el extracto fungíco tiene la capacidad de generar patogenicidad en explantes jóvenes de Opuntia sps. con síntomas similares a los generados por el hongo puro. A través de colectas a campo y pruebas de patogenicidad, se seleccionaron materiales resistentes y susceptibles a la enfermedad. Se realizó un análisis de ISSR con el DNA genómico de los genotipos de interés. Los resultados de ISSR fueron evaluados en un dendrograma y componentes principales; que mostró que existe un agrupamiento entre los genotipos obtenidos como resistentes (R) y susceptibles (S). Un aporte importante fue el perfil fitoquímico de elementos de defensa en cladodios de O. ficus-indica; los metabolitos analizados: taninos condensados, compuestos fenólicos totales, flavonoides, se encontraron en mayor cantidad en los genotipos resistentes en comparación con los susceptibles. Asimismo existen diferencias en el contenido de proteínas entre ambos genotipos.; In this research the causal phytopathogenic fungus Pseudocercospora opuntiae disease in cactus pear production systems (Opuntia sps.) for fruit and vegetable in western Mexico (Ojuelos and Zapopan, Jalisco) was morphologically and molecularly identified. The pathogenicity and virulence of the fungus that was shown in pre-cut cladodes, whole plants under field and greenhouse conditions, in vitro explants and Phaseolus vulgaris as a host specie. Also, different micropropagation and multiplication processes of selected genotypes with apparent health were used. In callus generation, Picloram showed a remarkable performance but it could not produce regeneration. It was not possible to find genotypes with embryogenic capacity. Propagation by pieces of pads was optimal to increase the selected material. The evaluated genotypes showed a differential response in terms of number and length of sprouts under the same environmental conditions and cladode age. It was established a protocol on seed germination of ten Opuntia sps. cultivars in vitro and ex vitro. Germination was increased by 40 % using mechanical scarification. It was shown that gibberellic acid plays an essential role in promoting germination (above 90 %), as in the remobilization of carbohydrates, by increasing the amylolytic activity in germinated seeds. Moreover it was obtained an extract of P. opuntiae in this enzymatic activities of amylase, cellulase and protease were evaluated. These enzymes are related to pathogenicity and virulence of the fungus. It was also observed that the extract has the ability to generate pathogenicity in young Opuntia sps. explants. The fungal extract causes similar symptoms to those generated by pure fungus. Through field selection and pathogenicity tests, resistant and susceptible genotypes to the disease were selected. ISSR analysis of genomic DNA with genotypes of interest was conducted. ISSR results were evaluated in a dendrogram and principal components it showed that there is a grouping among the genotypes obtained as resistant (R) and susceptible (S). An important contribution of the study was the determination of phytochemical elements of defense against biotic factors in O. ficus-indica cladodes. Condensed tannins, total phenolic compounds, and flavonoids, were found in greater amounts in resistant genotypes compared to susceptible ones. There are also differences in the protein content between genotypes.
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<dc:date>2015-01-01T00:00:00Z</dc:date>
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<title>Identificación de genes relacionados con defensa en tomate de cáscara (Physalis philadelphica) en respuesta a la infestación por mosquita blanca (Trialeurodes vaporariorum)</title>
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<description>Identificación de genes relacionados con defensa en tomate de cáscara (Physalis philadelphica) en respuesta a la infestación por mosquita blanca (Trialeurodes vaporariorum)
Quintana Camargo Martín
Centro universitario de Ciencias Biológicas y Agropecuarias; Universidad de Guadalajara
Las plantas en general, responden a la herbivoría de la mosca blanca a través de marcados cambios en la expresión génica. Para identificar los genes expresados diferencialmente en plantas de tomate de cáscara infestadas con Trialeurodes vaporariorum, plantas jóvenes fueron infestadas con adultos de mosca blanca. Bibliotecas sustractivas directa e inversa fueron construidas a partir de hojas infestadas por 5 y 15 d posteriores a la infestación. Varios genes implicados en respuestas de defensa en plantas a insectos succionadores fueron identificados. Entre los más representativos se detectaron aquellos que codifican a proteínas de síntesis, o de degradación, fortificación, o de modificación de pared celular, a genes necesarios para la biosíntesis de aminoácidos, metabolismo y síntesis de lípidos incluidos los componentes de pared celular tales como suberina, y genes de respuesta a estrés, o relacionados con la fotosíntesis. También se identificaron genes regulados negativamente, entre los que destacaron genes codificantes de quinasas y acuaporinas. Se obervaron similitudes en los perfiles de expresión de genes en respuesta a nematodos, áfidos, y mosca blanca. Así mismo, los resultados sugiren que el ácido abscisico, los brassinoesteroides y las citoquininas podrían estar participando en la regulación de la respuesta a la infestación por la mosca blanca en Physalis philadelphica debido sobre todo por los patrones de expresión de genes codificantes para proteínas con motivos tipo F-box, asociados con rutas de señalización de dichas hormonas.; All the plants respond to phloem-feeding whiteflies by extensive changes in gene expression. To identify differentially expressed genes in husk tomato plants (Physalis philadelphica) infested with Trialeurodes vaporariorum, young plants were challenged with adult whiteflies, and forward and reverse subtractive libraries were constructed from infested leaves at 5 and 15 d after infestation. Several genes were identified as up-regulated; these included a diversity of genes involved in plant defense responses, protein synthesis or degradation, and cell wall fortification or modification. Genes required for amino acid biosynthesis, lipid metabolism and synthesis, including cell surface components such as suberin, responses to stress, photosynthesis and other functions, were similarly induced. Down-regulated genes were also identified, most prominently kinases and aquaporin genes. Similarities in defense responses between tomato and P. philadelphica were noted regarding the expression of certain genes in response to nematodes, aphids, or whiteflies. A role for abscisic acid, brassinosteroids, and cytokinins in the regulated response to whitefly infestation in P. philadelphica was also implied by the expression pattern of phytohormone-associated genes, including genes coding for proteins containing F-box motifs, associated with signaling pathways of these hormones.
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